Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF6Q13247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF6Q13247 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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