Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RESTQ13127 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RESTQ13127 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RESTQ13127 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RESTQ13127 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RESTQ13127 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RESTQ13127 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RESTQ13127 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RESTQ13127 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RESTQ13127 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RESTQ13127 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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