Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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