Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO4P61968 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO4P61968 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMO4P61968 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMO4P61968 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms