Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPZBP47756 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms