Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms