Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XBP1P17861 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XBP1P17861 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XBP1P17861 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XBP1P17861 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms