Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF35P13682 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms