Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPAN13O95857 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms