Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF253O75346 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms