Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNT1O60563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms