Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC1BO15143 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms