Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms