Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF316A6NFI3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF316A6NFI3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms