Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA3Q9Y6H8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms