Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms