Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF8Q9UPP1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms