Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRN4Q9NRL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STRN4Q9NRL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms