Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB18Q9NP72 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms