Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARV1Q9H2C2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms