Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXQ1Q9C009 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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