Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS3Q9BZE2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms