Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDHD3Q9BSH5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms