Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms