Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRIM63Q969Q1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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