Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GATAD2BQ8WXI9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATAD2BQ8WXI9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms