Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNED1Q8TER0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNED1Q8TER0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms