Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD35Q8N283 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms