Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP221Q4G0U5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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