Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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LRRC36Q1X8D7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC36Q1X8D7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC36Q1X8D7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms