Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIBQ15653 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms