Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB3BPQ13352 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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