Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
IFFO1Q0D2I5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFFO1Q0D2I5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms