Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms