Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELF3P78545 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELF3P78545 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELF3P78545 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELF3P78545 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms