Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HBBP68871 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HBBP68871 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HBBP68871 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HBBP68871 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HBBP68871 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms