Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCS1P62166 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCS1P62166 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCS1P62166 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms