Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELLP55199 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELLP55199 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELLP55199 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELLP55199 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELLP55199 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELLP55199 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELLP55199 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELLP55199 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms