Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRAP54198 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRAP54198 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRAP54198 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIRAP54198 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIRAP54198 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIRAP54198 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms