Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COPAP53621 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COPAP53621 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COPAP53621 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COPAP53621 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms