Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP1P48552 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP1P48552 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP1P48552 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NRIP1P48552 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP1P48552 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP1P48552 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP1P48552 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms