Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms