Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEX2P28328 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEX2P28328 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEX2P28328 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEX2P28328 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms