Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA6AP0CW24 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms