Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP10P09238 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP10P09238 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP10P09238 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP10P09238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP10P09238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP10P09238 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms