Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms