Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFNA5P01569 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFNA5P01569 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms