Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYF2O95926 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYF2O95926 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYF2O95926 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYF2O95926 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYF2O95926 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYF2O95926 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYF2O95926 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms