Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D2O95562 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D2O95562 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms