Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 BRAT1-203ENST00000467558 4440 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.664e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.484e-7■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.666e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 318.49■□□□□ 0.556e-7■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 FAM214A-207ENST00000562135 581 ntTSL 56.9□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-6■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216■□□□□ 0.157e-7■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-21■■■■□ 20.3
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PRPF4O43172 SERPINA1-203ENST00000393088 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-21■■■■□ 20.3
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PRPF4O43172 SERPINA1-213ENST00000555289 609 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 SERPINA1-204ENST00000402629 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 SERPINA1-202ENST00000393087 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-21■■■■□ 20.3
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PRPF4O43172 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 ZNF443-202ENST00000436821 800 ntTSL 47.92□□□□□ -1.145e-7■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 SERPINA1-212ENST00000554720 446 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-21■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.65■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 220.07■□□□□ 0.87e-7■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 318.91■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 38.41□□□□□ -1.067e-7■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-207ENST00000512257 887 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 20.3
PRPF4O43172 BTF3-206ENST00000510787 610 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 20.3
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